Как мне настроить стратегию в терминале MoonBot, чтобы она выставляла ордера в шорт?

Для этого в настройке стратегии используйте параметр Short: Открывать short ордера вместо long. Для выставления short ордера необходимо наличие модуля “Binance Futures”, там же указаны особенности настройки шорт стратегий на фьючерсах.