Можно ли автоматически останавливать стратегию в терминале MoonBot, если она дала несколько минусовых сделок подряд?

Да, такая возможность есть и отвечает за такую настройку параметр PenaltyTime, который располагается на вкладке Filters / Time настроек стратегий терминала MoonBot.
В поле этого параметра Вы можете выставить время в секундах, в течение которого стратегия не будет работать по монете, на которой были 3 минусовые сделки подряд или ордер был отменен или выставлен вручную.

Чтобы этот параметр проверялся стратегией нужно на общей вкладке Filters установить IgnoreFilters = NO, а на вкладке Filters / Time нужно установить IgnoreTime = NO, при этом слева от вкладки Filters / Time должна гореть зеленая вертикальная полоска, по которой видно, что эта вкладка и параметры в ней не игнорируются.